Школьник Юга Одо считает систему поединков в игре «Дуэльные монстры» скучной и предсказуемой. Он решает внедрить в игру свою разработку под названием Rush Duels.

Появление людей из прошлого отца грозит Нэги новыми опасностями, и он начинает заключать контракты с разными учениками. Эти обстоятельства вынуждают его вместе с новыми партнёрами отправиться на поиски давн...