Четырнадцатилетний Сусуму участвует в секретном высокотехнологичном проекте под кодовым названием «Белый Пегас». Основной целью этого проекта является разработка системы уменьшения, которая позволила бы врачам проникать в тела заболевших людей и лечить их без операций. Однако главная цель проекта меняется, когда уменьшенная до микронного размера группа учёных, проникшая в тело пациента, сталкивается с инопланетными пришельцами. Миниатюрные чужаки производят какие-то опыты над человеческими телами. С первой встречи обе стороны находятся в постоянной гонке за обладание технологическим превосходством: земляне — чтобы изгнать пришельцев, а гости из космоса — чтобы найти некий таинственный Источник Жизни человека.